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产品名称:

环状RNA芯片定制检测服务

产品型号:
更新时间: 2022-04-13
描述:提供商: 杭州研谨生物
服务名称: 环状RNA芯片定制检测服务
规格: 实验服务
价格: 1000元
收费标准/服务周期/提供结果:
欢迎咨询详谈,我们会根据您的方案及需求制定详细的服务协议。
更多实验技术服务请浏览网站其他内容,或来电详询

产品介绍

品牌其他品牌价格区间面议
仪器种类微阵列芯片系统应用领域医疗卫生,生物产业

环状RNA芯片定制检测服务

 

 

实验技术简介: 环状RNA (ircRNA) 是区别于传统线性RNA的一类新型RNA,具有闭合环状结构,大量存在于真核转录组中。大部分的环状RNA是由外显子序列构成,在不同的物种中具有保守性,同时存在组织及不同发育阶段的表达特异性。由于环状RNA对核酸酶不敏感,所以比线性RNA更为稳定, 这使得环状RNA在作为新型诊断标记物的开发应用上具有明显优势。近来研究显示,环状RNA在不同物种中起到miRNA海绵的作用,称之为竞争性内源RNA (ceRNA) , 能竞争性结合miRNA。而与疾病关联性miRNA的相互作用说明环状RNA对疾病的调控起着非常重要的作用。

 

实验操作流程:

1、样品RNA抽提

2RNA质量检测

①使用Nanodrop测定RNA在分光光度计260nm280nm230nm的吸收值,以计算浓度并评估纯度。

②用甲醛电泳试剂进行变性琼脂糖凝胶电泳,检测RNA纯度及完整性。

③提供RNA QC报告。

3RNase R处理

4cDNA/aRNA样品合成和标记

5、标记效率质量检测使用Nanodrop检测荧光标记效率,标记效率合格以保证后续芯片实验结果的可靠性。

6、芯片杂交

在标准条件下将标记好的探针和高密度基因组芯片进行杂交。

7、图像采集和数据分析

使用GenePix 4000B芯月扫描仪扫描芯片的荧光强度,并将实验结果转换成数字型数据保存,使用配套软件对原始数据进行分析运算。

8、提供实验报告

Scanning Image: Cy3荧光扫描图像;

Scatter Plot:散点图,X轴为Control信号值,Y轴为Experiment信号值, 表示信号数据总体分布趋势;

Raw Data:探针的扫描荧光信号强度原始数据;

Normalized Data:经过统计学方法标准化后数值;

P-value: T-test统计分析显著差异表达的基因,p-value越小, 该circRNA在两组样本间差异表达越显著

significant Up & Down Regulated CircRNA List:显著差异表达的circRNA列表包含Fold Change, p-valuel以及circRNA的详细注释信息(相应的线性mRNAmiRNA结合位点)

 

客户提供:

1、实验对象为组织样品,取适量(50-100mg) 新鲜组织样品或正确保存的组织样品,使用

BioPulverizer TM冰冻粉碎组织,加1mRNA抽提试剂TRIzol (Invitrogen) ,使用Mini-Bead-Beater-16匀浆后抽提RNA

2、实验对象为细胞样品,每份样品取1x106~ 1x107细胞,加1mRNA抽提试剂TRIzol (样品为贴壁细胞,每10cm2培养皿TRIzo1使用量为1ml),裂解后抽提RNA

交付标准:

1、芯片检测数据

2、完整的实验操作规程、实验报告(含软件分析结果)以及实验材料


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