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产品名称:

平行反应监测技术(PRM)

产品型号:
更新时间: 2022-03-21
描述:提供商: 杭州研谨生物
服务名称: 平行反应监测技术(PRM) 实验服务
服务: 1-2周
规格: 实验服务
价格: 500元
收费标准/服务周期/提供结果:
欢迎咨询详谈,我们会根据您的方案及需求制定详细的服务协议。
更多实验技术服务请浏览网站其他内容,或来电详询!

产品介绍

品牌自营品牌产地类别国产
应用领域医疗卫生,生物产业

平行反应监测技术(PRM) :

PRM是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术,能够对目标蛋白质、目标肽段(如发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/肽段进行绝对定量。PRM技术基于Q-Orbitrap为代表的高分辨、高精度质谱平台,首先

利用四级杆质量分析器的选择能力,用Q1选择目标肽段的母离子,随后在Collision cell中对母离子进行碎裂,最后利用


<strong>平行反应监测技术(PRM)</strong> 实验步骤1.png




Orbitrap析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片信息。这样即可对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。

实验意义:

PRM技术是针对无抗体蛋白的验证新技术,用于label free, iTRAQ, TMT, SILAC等相对定量蛋白质组数据的验证,或对复杂样本中的目标蛋白质进行靶向定量分析。

实验步骤:

PRM进行蛋白质组数据验证的一般步骤为:

 

结果展示

结果展示图2.png

 

实验完成周期及交付标准:

1.实验周期: --PRM时间为: 5-10

2.交付标准:

组学验证:

主要仪器、试剂和实验方法。

②PRM目标离子信息:肽段序列和定量子离子。

方法学重复性评价:三次技术重复的色谱峰面积相对标准偏差(RSD) (预实验结果)

实验结果:二级图谱,XIC图谱,原始峰面积强度值,矫正后的相对表达量,两组样本间的相对比值,ttest p值。

相对/绝对定量:

主要仪器、试剂和实验方法。

②PRM目标离子信息:肽段序列和定量子离子。

方法学评价:相对定量的重复性评价-测试样本的三次技术重复的色谱峰面积相对标准偏差(RSD) (预实验结果) ;

绝对定量的方法学评价-标准品XIC图谱,LODLOQ,线性范围, 6个稀释梯度得到的标准曲线及线性公式(每个稀释度有3次技术重复)

实验结果:

相对定量:二级图谱,XIC图谱,原始峰面积强度值,矫正后的相对表达量,两组样本间的相对比值,ttest p值。

绝对定量:二级图谱,XIC图谱,原始峰面积强度值,根据标准曲线计算得到的蛋白质浓度值,两组样本间的相对比值,ttest p值。

需确认的信息:

1.样品:

如果样品为蛋白质溶液,蛋白质总量≥300mg;

如果是组织样品,样品总量≥0.1g;如果是细胞样品,细胞数量≥107;

如果是体液样品,血清≥200ml,脑脊液≥200ml, 尿液≥1ml,泪液≥1ml

2.样品采集过程中使用到塑料制品时,尽量使用无色进口产品,以减少塑料制品中杂质对质谱检测的影响。

文献参考

[1] Navin Rauniyar. Parallel Reaction Monitoring: A Targeted Experiment Performed Using High Resolution and HighMass Accuracy Mass Spectrometry. IntJ Mol Sci. 2015 Dec; 16(12): 28566- -28581.

 


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